私はメインでiMac、移動時はMacBook Proを使っているのですが、どちらでも時々起こる、
漢字の予測変換のボックスが消えずに残ってしまう怪現象。
知ってるとすぐ解消できるので、どうぞ!!
Spotlight検索で「アクティビティモニタ」を検索
アクティビティモニタをどこで探すかわからなくても、画面右上の虫眼鏡マークをクリックすると、「Spotlight検索」というバーが画面に現れるので、そこに「アクティビティモニタ」と打ち込めば、下のようになります。

「日本語入力プログラム」を探してクリック
この中から「日本語入力プログラム」というのを探してダブルクリック。
日本語入力プログラムを「終了」させる
というわけで、日本語入力プログラムの「終了」ボタンを押してください。

「このプロセスを終了してもよろしいですか?」
と出てくるので

「終了!」

はい、この通り。
消えました〜!
ちなみにこの怪現象は、Mac OS X 10.11(El Capitan・エルキャピタン)でよく出てくるんですって。私の両方それだわ。
マックって、知ってたらすぐ解決できたのに、っていうこと割とありますよね。
また次回に私がトラブったら、簡単に解決できる方法を書き留めますね!
今日も読んでいただいてありがとうございました。
【Mac】漢字の予測変換の枠が消えない!対処法